企业可以申请行政复议或者提起行政诉讼来维护自身的合法权益 。
在市场经济体制下，企业的经营自主权是其发挥核心竞争力、实现可持续发展的重要基础。然而，随着我国市场经济的不断发展，企业在追求经营自主权的过程中，也面临着诸多法律风险。因此，加强企业经营自主权的法律保障和实施显得尤为重要。
一、企业经营自主权的法律保障
完善相关法律法规体系。政府应当制定和完善相关法律法规，明确企业经营自主权的范围和限制，为企业经营自主权提供有力的法律保障。
建立健全企业法人制度。企业法人制度是保障企业经营自主权的基本制度安排，包括公司法、合伙企业法等。通过完善企业法人制度，确保企业在法律层面享有充分的经营自主权。
强化合同法律制度。合同是企业经营自主权的具体体现，因此，强化合同法律制度对于保障企业经营自主权具有重要意义。政府应当加强对合同法律制度的宣传和培训，提高企业和个人的合同意识。
保护知识产权。知识产权是企业竞争力的核心，也是企业经营自主权的重要组成部分。政府应当加大对知识产权的保护力度，打击侵犯企业知识产权的行为。
二、企业经营自主权的实施
加强政府监管。政府应当加强对企业经营活动的监管，防止滥用行政权力干预企业正常经营活动，损害企业的经营自主权。
促进公平竞争。政府应当采取措施，打击不正当竞争行为，维护市场秩序，为企业创造一个公平、有序的市场环境，保障企业的经营自主权。
鼓励企业创新。政府应当通过税收优惠、政策扶持等手段，鼓励企业进行技术创新、管理创新等，提高企业的核心竞争力，从而实现企业的经营自主权。
建立企业纠纷解决机制。政府应当建立完善的企业纠纷解决机制，为企业提供便捷、高效的纠纷解决途径，有效维护企业的经营自主权。
加强企业经营自主权的法律保障和实施，对于促进我国市场经济的发展具有重要意义。政府应当从完善法律法规体系、加强监管、促进公平竞争等方面入手，切实保障企业的经营自主权。
